Jena hat die bundesweit höchste Dichte von Forschungseinrichtungen bezogen auf die Einwohnerzahl (Städteranking 2017, IW Consult). Die Wissenschaftlerinnen und Wissenschaftler der Friedrich-Schiller-Universität Jena und der außeruniversitären Forschungseinrichtungen sowie der forschenden Stiftungen in Jena und der Region pflegen eine außergewöhnlich enge Zusammenarbeit.
Max-Planck-Institut für Biogeochemie
Max-Planck-Institut für chemische Ökologie
Max-Planck-Institut für Menschheitsgeschichte
Leibniz-Institut für Naturstoff-Forschung und Infektionsbiologie - Hans-Knöll-Institut (HKI)
Leibniz-Institut für Alternsforschung - Fritz-Lipmann-Institut (FLI)
Leibniz-Institut für Photonische Technologien (IPHT)
DLR-Institut für Datenwissenschaften
Fraunhofer-Institut für Angewandte Optik und Feinmechanik (IOF)
Fraunhofer-Institut für Keramische Technologien und Systeme