Mit über 500 europäischen und außereuropäischen Partnerhochschulen und Forschungseinrichtungen auf allen Kontinenten pflegt die Universität Jena den Austausch von Studierenden, Wissenschaftler/innen und Mitarbeiter/innen. Sie ist Partnerin in einer Reihe von internationalen Forschungs- und Hochschulverbünden, in großen EU-Projekten und interdisziplinären Netzwerken.